O Incor mantém cursos de pós-graduação latu sensu nas modalidades de residência, de especialização e de estágios curriculares e de curta duração nas áreas médica e multiprofissional.
Os programas cobrem, na área médica, as especialidades de cardiologia, pneumologia, cirurgia cardiovascular e cirurgia torácica.
No segmento multiprofissional, eles envolvem a áreas de: enfermagem, farmácia, fisioterapia, informática, laboratório clínico, nutrição, odontologia, psicologia clínica, reabilitação cardiovascular, serviço social e radiologia.
Todos os cursos seguem a política educacional e a regulamentação emanada da Comissão de Ensino do Instituto, em consonância com o Hospital das Clínicas e FMUSP.